¿La arena de dónde la sacaste?
Descríbenos los bichos. ¿Podrían ser colémbolos? Si son éstos no creo que interfieran con la salud de tu animal, aunque la verdad me resulta difícil pensar que se reprodujeran estos bichos dadas las condiciones en las que tendría que estar la pogona.
Sustratos para pogonas hay muchos dado que no requieren de humedad, te sirve casi cualquier cosa, el tema es que la pogona, sea el sustrato que sea, no se dedique a comérselo, tanto queriendo como sin querer. Es decir, si tienes arena (la cual no debería ingerir ya que le puede provocar problemas), pero de ninguna manera la ingiere, ya sea conscientemente, o al comer la comida que le puedas dar, puedes usarla tranquilamente. Eso sí, debes tener cuidado con que la arena que estés usando no provoque demasiado polvo, ya que esto también le puede afectar.
Al final el tema del sustrato es que con las heces que haga, pueda absorberlas y facilite su retirada.