Si, el problema es que cuando avances 10 generaciones, seguramente se olvide que provenía de un cruce. En esos casos pocos restos habrá del primer cruce si los siguientes se han hecho con un solo tipo de animal (p.e. un primer cruce de ruthveni x alterna y los consiguientes solo con ruthveni) pero aún así, aunque sea en un porcentaje muy pequeño, hay sigue el cruce.
No sé hasta que punto esto es perjudicial, pero...
Los más entendidos, entre los que seguro estás tú, sabrán más.
Desde luego no soy crítico de esto, ni mucho menos. Solo algo receloso. Tus animales son envidiables.