Pues por lo que describes se me ocurre que pueda ser un problema serie de calidad del agua. Tienes un volumen total de agua pequeño (el minimo recomendable son 40l, y creeme que hay diferencia), los cambios de agua tan gordos seguramente te esten reseteando el ciclado cada vez que los haces y los alimentos congelados en cubito ensucian mucho el agua y se descomponen muy rapido. Mi hipotesis seria que el resultado de estos factores hace que tengas picos de amoniaco y nitritos bastante fuertes y que eso haya llevado a las muertes y el desarrollo de enfermedades.
El filtro si solo lo enciendes de vez en cuando no sirve absolutamente para nada porque la esponja no se puede colonizar de bacterias, asi que lo unico que tienes es un motor moviendo el agua, lo cual encima para esta especies es mala idea porque prefieren aguas sin ningun movimiento.
Aprovecha el mayor volumen posible, si tienes 60l totales, puedes tranquilamente aprovechar 55-56 de agua (con una buena tapa). Esto hara que sea muchisimo mas estable.
Suena a que tienes pocas plantas, asi que llena bien el acuario, cuantas mas mejor. Las plantas realizaran una filtracion biologica que es lo que te aportaria el filtro si lo usases correctamente, pero si corrientesm ademas de que a estos tritones les encanta esconderse entre marañas de plantas cerca de la superficie.
La alimentacion es pobre, y a la larga puede llevar a graves deficiencias. La base de la dieta deberian ser lombrices.
En cuanto al triton que te queda siento decirte que las probabilidades de que sobreviva son bajas. Intenta hacer baños de sal:
http://www.caudata.org/cc/articles/salt.shtml
Tambien puedes probar a aplicar en medio terrestres, dos veces al dia una pequeña cantidad de Neosporina vaginal.
Te lo he puesto todo asi un poco resumido y con prisas porque no tengo mucho tiempo, pero hay un monton de posts en esta seccion que te puedes leer y te seran utiles. Ademas el link que te he puesto antes contiene muchisima informacion de excelente calidad.