Hola Kirbylazy, intentaré echarte una mano con el tema.
Lo primero es, como ya te han comentado, que tienes que ciclar ese acuario, y eso no tendrá lugar antes de unos 20 días de montado el acuario (generalmente sobre 30 días) y solo lo puedes saber mediante mediciones de NH4, No2 y No3. Cuando los dos primeros valores te den 0 y el tercero te de positivo (entre 10 y 20, si es más tendrás que hacer un cambio de agua antes de introducir peces), ya podrás introducir tus primeros habitantes.
El filtro que comentas se ve bastante escaso para ese acuario y para mantener una población numerosa de peces. Yo te recomendaría que te mirases un filtro de mochila, Aquaclear por ejemplo, que te ofrece mucho más volumen filtrante, más caudal y además no te ocupa espacio dentro del acuario. El material filtrante imprescindible en un acuario, aparte de las esponjas es el cerámico, del que supongo que tú careces, que es la base de la colonia bacteriana que mantendrá estable tu acuario, te recomiendo que no escatimes en el filtro...es el corazón del acuario. El carbón no es imprescindible, solo se utiliza para retirar medicamentos u otros productos químicos del agua o para mantener ésta lo más transparente posible.
En cuanto a las plantas, si es un acuario de kit no te traerá más de 14-15w, que para 40l de acuario es bastante poco, por lo que las plantas a elegir deberán ser aquellas que aguanten con poca luz: anubias, microsorium, ambulia, hygropylas,etc La elodea que comentas que se te está estropeando, es una planta que no soporta las temperaturas de un acuario tropical, se utiliza en acuarios de "agua fría", por lo que no creo que te salga adelante.
En cuanto a los peces que vayas a introducir....lo primero es saber qué agua tienes (mide ph, kh y gh principalmente) y en base a ese agua se eligen los peces, o se modifica el agua para poder tener unos peces determinados, no se si me explico.
Los que dices que tienen manchas blancas y están pachuchos posiblemente tengan punto blanco o alguna infección bacteriana derivada del mal estado del agua (está en pleno ciclado, el agua es tóxica para ellos). Mi consejo es que les busques otro hogar....amigos, tiendas....alguien que te los pueda acoger porque en ese acuario solo sobrevivirán los más fuertes o los que más suerte tengan....si es que te sobrevive alguno
Y nada, como información complementaria, aparte de las webs que te recomendaron tienes en marino: www.e-coralia.net y para acuariofilia en general: www.acuaterra.net que es la web de la Asociación Galega de Acuariofilia e Terrrariofilia a la que pertenezco.
Espero haberte sido de ayuda, y para cualquier duda que tengas por aquí andamos